El monasterio de Sant Bernat de Rascanya pertenecía a la orden del Císter. Los cistercienses o también llamados monjes blancos, por el color de su hábito, basaban su vida monástica en tres actividades: la lectura, la plegaria y el trabajo manual.

San Miguel de los Reyes estaba regido por la orden de San Jerónimo. Era una orden dedicada a la contemplación y la alabanza divina, destacándose por la devoción con que celebraban los oficios religiosos y por la belleza de sus cantos.

La orden estuvo muy vinculada a la monarquía y la nobleza. Monasterios tan relevantes como El Escorial, Guadalupe o Yuste estuvieron regidos por la orden jerónima.

Después de la Desamortización, el edificio fue abandonado hasta 1874, fecha en la cual se decidió construir una prisión. Este nuevo uso supuso la creación de dos grandes pabellones y un patio en la zona norte. Fue presidio hasta 1966.